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我觉得有2种可能
1.芯片不一致，由于中兴的OLT芯片是PMC-Sierra，可能是A家的ONU芯片也是PMC-Sierra的，而B家ONU芯片跟A家的不同，兼容性不好，升级后修改了某些配置就可以兼容了。
2.EPON的互通性问题分为3个层次：传输层的互通、业务层的互通和管理层的互通，必须实现这3个层次的互通，才能实现真正意义上的EPON系统互通。B家下面挂载其他设备如交换机，由于每个ONU加入到EPON系统都需要一个MPCP会话和OAM会话在MPCP的流程中，存在几个参数，如在Discovery Gate和Register消息中的同步时间（synctime），Normal Gate消息中的ONU的开窗时间（grantlength）等。如果synctime的定义不一致或者grantlength值偏小，都会导致MPCP发现过程无法完成或者业务不通。解决办法是要求厂商统一按照IEEE 802.3ah的最新修订版本设置synctime值，同时使OLT的grantlength值要略大一些（>0x8A）。可能升级过程修改了这些参数。另外不同的业务模式对EPON的互通性有着不同的要求。一般来讲，除普通上网业务、普通数据业务外，EPON系统还要能够提供语音、视频等业务，针对特定的业务，可能有不同的实现协议和具体参数，这种实现上的差异性会导致互通问题。

我个人水平有限，以上是我的个人理解，有不对的地方请大家批评指正，谢谢！

我去理解其中过程，谢谢