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目前我了解的：
MSAP的初衷是为了解决以前DDF配线架上需要落下很多2M，并将原来的PDH拉入到同一的管理中，也可以介入光纤收发器平台，其目的主要是为了将运营商原有的设备统一管理起来，随着后面对IP的发展，要求将数据和传输的结合，也将以太网做到MSAP平台上了，不过其本质，使用的最多的还是VLAN，QOS及HQOS涉及的很少，还有关于协议STP等的实现要求，主要集中在QINQ技术的创新上，当然这样需要占用很多的SDH光口，以太网口在接入层面，接入厂家（除原来有交换机设计基础的公司）基本对数据这块一片空白，很多的以太网问题无法搞定。
EPON：除了存在需要的保护外，没发现有其他技术上的瑕疵，作为PTN+PON在接入方案还是主流方式。

个人建议：保护原有设备的延续使用和增强管理功能，可以使用MSAP；但对于新的开拓，建议采用PTN+PON的方案，可以将MSAP淘汰。